هیئت رئیسه مؤسسه شامل رئیس مؤسسه و معاونان مرتبط است و نقش کلیدی در سیاست‌گذاری، تصمیم‌گیری و نظارت بر امور اجرایی مؤسسه دارد. هیئت رئیسه در تصمیم‌گیری‌های کلان پژوهشی و آموزشی نقش دارد و مصوبات شوراهای تخصصی را جهت اجرا هدایت می‌کند و بر حسن اجرای برنامه‌های مصوب و آیین‌نامه‌ها نظارت دارد.